GOPHERSPACE.DE - P H O X Y
gophering on origin.rxivist.org
               _____          _         _       _
              |  __ \        (_)       (_)     | |
              | |__) |__   __ _ __   __ _  ___ | |_
              |  _  / \ \ / /| |\ \ / /| |/ __|| __|
              | | \ \  \ v / | | \ V / | |\__ \| |_
              |_|  \_\  > <  |_|  \_/  |_||___/ \__|
                       / ^ \
                      /_/ \_\
                      TRENDING OPEN SCIENCE
-------------
Detecting turnover among complex communities using null models: A case
study with sky-island haemosporidian parasites
--------
By
  Lisa N. Barrow
  Selina M Bauernfeind
  Paxton A Cruz
  Jessie L. Williamson
  Daniele L Wiley
  John E Ford
  Matthew J. Baumann
  Serina S Brady
  Andrea N Chavez
  Chauncey R. Gadek
  Spencer C. Galen
  Andrew B Johnson
  Xena M Mapel
  Rosario A Marroquin-Flores
  Taylor E Martinez
  Jenna M McCullough
  Jade E McLaughlin
  Christopher C. Witt

DOI: 10.1101/2020.04.17.046631

On bioRxiv: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.17.046631v1

Turnover in species composition between sites, or beta diversity, is a
critical component of species diversity that is typically influenced
by geography, environment, and biotic interactions. Quantifying
turnover is particularly challenging, however, in multi-host, multi-
parasite assemblages where undersampling is unavoidable, resulting in
inflated estimates of turnover and uncertainty about its spatial
scale. We developed and implemented a framework using null models to
test for community turnover in avian haemosporidian communities of
three sky islands in the southwestern United States. We screened 776
birds for haemosporidian parasites from three genera (
Parahaemoproteus , Plasmodium , and Leucocytozoon ) by amplifying and
sequencing a mitochondrial DNA barcode. We detected infections in 280
birds (36.1%), sequenced 357 infections, and found a total of 99
parasite haplotypes. When compared to communities simulated from a
regional pool, we observed more unique, single-mountain haplotypes and
fewer haplotypes shared among three mountain ranges than expected,
indicating that haemosporidian communities differ to some degree among
adjacent mountain ranges. These results were robust even after pruning
datasets to include only identical sets of host species, and they were
consistent for two of the three haemosporidian genera. The two more
distant mountain ranges were more similar to each other than the one
located centrally, suggesting that the differences we detected were
due to stochastic colonization-extirpation dynamics. These results
demonstrate that avian haemosporidian communities of temperate-zone
forests differ on relatively fine spatial scales associated with
adjacent sky-islands. Null models are essential tools for detecting
turnover in complex, undersampled, and poorly known systems.

### Competing Interest Statement

The authors have declared no competing interest.

---
RANKS:
314 downloads all time
  - Overall rank: 77679
  - Rank in ecology: 2358


______________________________________________________________________
                                          Served by Flask-Gopher/2.0.0