_____          _         _       _
              |  __ \        (_)       (_)     | |
              | |__) |__   __ _ __   __ _  ___ | |_
              |  _  / \ \ / /| |\ \ / /| |/ __|| __|
              | | \ \  \ v / | | \ V / | |\__ \| |_
              |_|  \_\  > <  |_|  \_/  |_||___/ \__|
                       / ^ \
                      /_/ \_\
                      TRENDING OPEN SCIENCE
-------------
SARS-CoV-2 RNA reverse-transcribed and integrated into the human
genome
--------
By
  Liguo Zhang
  Alexsia Richards
  Andrew Khalil
  Emile Wogram
  Haiting Ma
  Richard A. Young
  Rudolf Jaenisch

DOI: 10.1101/2020.12.12.422516

On bioRxiv: https://biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.12.422516v1

Prolonged SARS-CoV-2 RNA shedding and recurrence of PCR-positive tests
have been widely reported in patients after recovery, yet these
patients most commonly are non-infectious. Here we investigated the
possibility that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse-transcribed and
integrated into the human genome and that transcription of the
integrated sequences might account for PCR-positive tests. In support
of this hypothesis, we found chimeric transcripts consisting of viral
fused to cellular sequences in published data sets of SARS-CoV-2
infected cultured cells and primary cells of patients, consistent with
the transcription of viral sequences integrated into the genome. To
experimentally corroborate the possibility of viral retro-integration,
we describe evidence that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse transcribed
in human cells by reverse transcriptase (RT) from LINE-1 elements or
by HIV-1 RT, and that these DNA sequences can be integrated into the
cell genome and subsequently be transcribed. Human endogenous LINE-1
expression was induced upon SARS-CoV-2 infection or by cytokine
exposure in cultured cells, suggesting a molecular mechanism for SARS-
CoV-2 retro-integration in patients. This novel feature of SARS-CoV-2
infection may explain why patients can continue to produce viral RNA
after recovery and suggests a new aspect of RNA virus replication.

---
RANKS:
70152 downloads all time
  - Overall rank: 71
  - Rank in genomics: 2


______________________________________________________________________
                                          Served by Flask-Gopher/2.0.0